Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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