Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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