Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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HIST2H2BEQ16778 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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HIST2H2BEQ16778 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HIST2H2BEQ16778 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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HIST2H2BEQ16778 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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HIST2H2BEQ16778 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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HIST2H2BEQ16778 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HIST2H2BEQ16778 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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