Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FXNQ16595 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FXNQ16595 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms