Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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