Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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