Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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