Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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