Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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