Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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