Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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DDX39BQ13838 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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DDX39BQ13838 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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DDX39BQ13838 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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DDX39BQ13838 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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