Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APOFQ13790 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms