Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms