Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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