Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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