Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms