Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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