Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3AQ13472 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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