Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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