Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.844e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 FBXO3-207ENST00000530013 3740 ntTSL 1 (best)9.5□□□□□ -0.891e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PRR3-203ENST00000470703 3429 ntTSL 29.46□□□□□ -0.91e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SSBP2-212ENST00000509053 1534 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.94e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.961e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.031e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 COX17-204ENST00000486606 430 ntTSL 38.42□□□□□ -1.061e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 DARS2-203ENST00000471476 893 ntTSL 48.07□□□□□ -1.121e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SEPT7-204ENST00000425198 6952 ntTSL 57.69□□□□□ -1.181e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SSBP2-204ENST00000504985 1396 ntTSL 57.44□□□□□ -1.224e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SSBP2-214ENST00000510060 1042 ntTSL 37.43□□□□□ -1.224e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.271e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.311e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.381e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.391e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ERGIC2-207ENST00000549182 565 ntTSL 56.29□□□□□ -1.41e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.411e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.421e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.441e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 COX17-207ENST00000497997 565 ntTSL 25.71□□□□□ -1.51e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 DYNC1LI2-205ENST00000563628 355 ntTSL 55.19□□□□□ -1.581e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.631e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 CAPN2-205ENST00000472601 625 ntTSL 34.8□□□□□ -1.641e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 CAPN2-211ENST00000492664 590 ntTSL 34.8□□□□□ -1.641e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.821e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.351e-10■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 YARS-209ENST00000490826 2178 ntTSL 214.17□□□□□ -0.141e-10■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 YARS-203ENST00000469100 2247 ntTSL 212.98□□□□□ -0.331e-10■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-10■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 EIF2AK1-202ENST00000422786 782 ntTSL 314.08□□□□□ -0.162e-10■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 C14orf2-208ENST00000554713 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.165e-8■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 C14orf2-212ENST00000557260 856 ntTSL 1 (best)12.36□□□□□ -0.435e-8■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 C14orf2-205ENST00000554089 932 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.885e-8■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SSR3-202ENST00000463503 596 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.216e-9■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SSR3-203ENST00000464138 533 ntTSL 37.99□□□□□ -1.136e-9■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SSR3-207ENST00000478842 612 ntTSL 37.99□□□□□ -1.136e-9■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SSR3-209ENST00000498205 593 ntTSL 26.92□□□□□ -1.36e-9■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ASL-209ENST00000493708 885 ntTSL 331■■■□□ 2.552e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.642e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.052e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.982e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ASL-206ENST00000464970 640 ntTSL 318.68■□□□□ 0.582e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.572e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ASL-208ENST00000488343 198 ntTSL 318.46■□□□□ 0.552e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 RTN2-203ENST00000430715 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 AC068533.4-201ENST00000450043 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 AUP1-203ENST00000462297 457 ntTSL 311.71□□□□□ -0.531e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.882e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.221e-22■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.091e-22■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 516.58■□□□□ 0.241e-22■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 212.5□□□□□ -0.411e-22■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 CALM2-205ENST00000460218 4502 ntTSL 1 (best)2□□□□□ -2.091e-22■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.065e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ARCN1-205ENST00000614498 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.715e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.125e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.265e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.234e-12■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.588e-13■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.848e-13■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.434e-9■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.644e-9■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ATIC-206ENST00000442048 442 ntTSL 39.32□□□□□ -0.921e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ATIC-212ENST00000478734 486 ntTSL 25.31□□□□□ -1.561e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.448e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.58e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.548e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PCYT2-207ENST00000571581 999 ntTSL 531.35■■■□□ 2.617e-8■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PCYT2-213ENST00000573401 1028 ntTSL 529.48■■■□□ 2.317e-8■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PCYT2-214ENST00000573636 913 ntTSL 529.12■■■□□ 2.257e-8■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PCYT2-210ENST00000572473 575 ntTSL 525.21■■□□□ 1.637e-8■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.035e-8■□□□□ 9
PABPC4Q13310 NCAPG-205ENST00000514176 3017 ntTSL 1 (best)12.96□□□□□ -0.345e-8■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.22e-12■□□□□ 9
PABPC4Q13310 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.233e-23■□□□□ 9
PABPC4Q13310 CKS1B-206ENST00000474215 739 ntTSL 313.48□□□□□ -0.253e-23■□□□□ 9
PABPC4Q13310 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.513e-23■□□□□ 9
PABPC4Q13310 CKS1B-207ENST00000477676 602 ntTSL 35.6□□□□□ -1.513e-23■□□□□ 9
PABPC4Q13310 RACK1-204ENST00000502890 705 ntTSL 312.21□□□□□ -0.452e-60■□□□□ 9
PABPC4Q13310 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.681e-9■□□□□ 9
PABPC4Q13310 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.682e-9■□□□□ 9
PABPC4Q13310 P4HB-208ENST00000473021 914 ntTSL 1 (best)18.44■□□□□ 0.542e-9■□□□□ 9
PABPC4Q13310 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.52e-9■□□□□ 9
PABPC4Q13310 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-9■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 516.21■□□□□ 0.193e-36■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.073e-36■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 215.28■□□□□ 0.043e-36■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.033e-36■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.023e-36■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.123e-36■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.183e-36■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPH1-206ENST00000502904 2913 ntTSL 211.08□□□□□ -0.643e-36■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPH1-227ENST00000515481 5564 ntTSL 27.08□□□□□ -1.283e-36■□□□□ 9
PABPC4Q13310 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.471e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ANXA7-201ENST00000372919 2174 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.136e-16■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ANXA7-202ENST00000372921 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.656e-16■□□□□ 9
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 255.1 ms