Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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