Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms