Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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