Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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