Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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