Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms