Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms