Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms