Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms