Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms