Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FAM209A-201ENST00000371328 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SUCLG2P4-201ENST00000514739 1027 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms