Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms