Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms