Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms