Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms