Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms