Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms