Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms