Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms