Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms