Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms