Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms