Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UFM1P61960 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UFM1P61960 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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