Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ACTBP60709 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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