Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL23P55773 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL23P55773 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL23P55773 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL23P55773 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms