Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC13P55735 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms