Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPOLAP51003 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms