Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF6P49848 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms