Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC2P49815 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC2P49815 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC2P49815 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSC2P49815 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms