Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLK1P49759 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLK1P49759 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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